برای اجرای آب بندی مخازن از دو روش استفاده می کنیم . روش اول شامل مسدود نمودن لوله های مویین است که در بخش آب بندی بتن به آن اشاره گردید . روش دوم شامل استفاده از یک لایه عایق می باشد که پس از آماده سازی سطوح بر روی آنها اجرا می گردد . توجه به وضعیت و شرایط سطح بستر عایق و خصوصیات لایه عایق از مهمترین نکات قابل توجه می باشد . همچنین ، توجه به این نکته لازم است که به دليل وجود تركهاي ناشي از جمع شدگي در بتن اجرا شده در كف سازه ها ، جهت اجراي آب بندی مخازن بايستي از موادي استفاده نمایيم كه علاوه بر دارا بودن قدرت چسبندگي بالا به انواع مصالح ساختماني ، از انعطاف پذيري بالایي نيز برخوردار باشند و تحت تاثير عوامل مختلف ، خواص و نفوذ ناپذیری خود را از دست ندهند